Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIPAP38571 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIPAP38571 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms