Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms