Protein–RNA interactions for Protein: P28324

ELK4, ETS domain-containing protein Elk-4, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK4P28324 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms