Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGCP20142 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGCP20142 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGCP20142 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGCP20142 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGCP20142 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGCP20142 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PGCP20142 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGCP20142 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms