Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A1P19634 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms