Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOL3O95236 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOL3O95236 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms