Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GMDSO60547 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMDSO60547 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms