Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3BML4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3BML4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3BML4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms