Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDY1Q9Y6F8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDY1Q9Y6F8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDY1Q9Y6F8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDY1Q9Y6F8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms