Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6E7

SIRT4, NAD-dependent protein lipoamidase sirtuin-4, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT4Q9Y6E7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRT4Q9Y6E7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT4Q9Y6E7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIRT4Q9Y6E7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms