Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z0

BACE2, Beta-secretase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE2Q9Y5Z0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BACE2Q9Y5Z0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BACE2Q9Y5Z0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BACE2Q9Y5Z0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BACE2Q9Y5Z0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms