Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G9

PCDHGA4, Protocadherin gamma-A4, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA4Q9Y5G9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHGA4Q9Y5G9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHGA4Q9Y5G9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHGA4Q9Y5G9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms