Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR2E1Q9Y466 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR2E1Q9Y466 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NR2E1Q9Y466 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms