Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3V2

RWDD3, RWD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD3Q9Y3V2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RWDD3Q9Y3V2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RWDD3Q9Y3V2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RWDD3Q9Y3V2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD3Q9Y3V2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD3Q9Y3V2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD3Q9Y3V2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD3Q9Y3V2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RWDD3Q9Y3V2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD3Q9Y3V2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD3Q9Y3V2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD3Q9Y3V2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD3Q9Y3V2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RWDD3Q9Y3V2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RWDD3Q9Y3V2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RWDD3Q9Y3V2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms