Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT52Q9Y366 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT52Q9Y366 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT52Q9Y366 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms