Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y320

TMX2, Thioredoxin-related transmembrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2Q9Y320 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMX2Q9Y320 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMX2Q9Y320 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMX2Q9Y320 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMX2Q9Y320 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms