Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC2Q9Y2U9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms