Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP2BQ9UQN3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms