Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN6Q9UQ52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN6Q9UQ52 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CNTN6Q9UQ52 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN6Q9UQ52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms