Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A2Q9UPR5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A2Q9UPR5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms