Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
TRIM35Q9UPQ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRIM35Q9UPQ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRIM35Q9UPQ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms