Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRPK3Q9UPE1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms