Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP18Q9UMW8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP18Q9UMW8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP18Q9UMW8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP18Q9UMW8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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