Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNPO2Q9UMS6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms