Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4EQ9ULY5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC4EQ9ULY5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4EQ9ULY5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4EQ9ULY5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4EQ9ULY5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4EQ9ULY5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC4EQ9ULY5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLEC4EQ9ULY5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4EQ9ULY5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms