Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRFN2Q9ULH4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRFN2Q9ULH4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRFN2Q9ULH4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms