Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SARDHQ9UL12 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SARDHQ9UL12 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SARDHQ9UL12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms