Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA1Q9UJY5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA1Q9UJY5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA1Q9UJY5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA1Q9UJY5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA1Q9UJY5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA1Q9UJY5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA1Q9UJY5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GGA1Q9UJY5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGA1Q9UJY5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms