Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCTN4Q9UJW0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCTN4Q9UJW0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms