Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD2

TBK1, Serine/threonine-protein kinase TBK1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBK1Q9UHD2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TBK1Q9UHD2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TBK1Q9UHD2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms