Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN1Q9P244 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN1Q9P244 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN1Q9P244 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN1Q9P244 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN1Q9P244 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN1Q9P244 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms