Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNRD1Q9P1U0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNRD1Q9P1U0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms