Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACD3Q9P035 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HACD3Q9P035 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACD3Q9P035 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms