Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL39Q9NYK5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL39Q9NYK5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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