Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN3BQ9NY72 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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