Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR3BQ9NW08 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3BQ9NW08 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3BQ9NW08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3BQ9NW08 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms