Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASF1BQ9NVP2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms