Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3AQ9NVI7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms