Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RRP7BPQ9NSQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RRP7BPQ9NSQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RRP7BPQ9NSQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms