Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SALL1Q9NSC2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL1Q9NSC2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SALL1Q9NSC2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms