Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HELLSQ9NRZ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HELLSQ9NRZ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HELLSQ9NRZ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms