Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHPT1Q9NRX4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHPT1Q9NRX4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHPT1Q9NRX4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHPT1Q9NRX4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms