Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNNM1Q9NRU3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNNM1Q9NRU3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNNM1Q9NRU3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNNM1Q9NRU3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms