Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBQLN4Q9NRR5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBQLN4Q9NRR5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBQLN4Q9NRR5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms