Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
STRN4Q9NRL3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
STRN4Q9NRL3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
STRN4Q9NRL3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRN4Q9NRL3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms