Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPHK2Q9NRA0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPHK2Q9NRA0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHK2Q9NRA0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms