Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FZD3Q9NPG1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms