Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPHS2Q9NP85 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPHS2Q9NP85 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPHS2Q9NP85 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPHS2Q9NP85 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms