Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA8Q9NP80 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA8Q9NP80 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA8Q9NP80 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms