Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms