Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMG20AQ9NP66 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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